Types d’échantillons traités
Bioalternatives peut réaliser l’étape d’extraction d’ARN à partir de :
- Culture cellulaires (monocouches ou suspension)
- Bactéries
- Tissus reconstruits en culture
- Modèles ex vivo en culture
- Prélèvements (sang, tissus)
Recommandations :
Dans le cadre d’envoi d’échantillons, il est important de prendre les précautions nécessaires afin d’éviter que ceux-ci ne se dégradent pendant leur transport; un envoi en carboglace est préconisé. Concernant l’envoi de tissus, un traitement préalable au RNAlater est conseillé.
Etape d’extraction
De manière standard, Bioalternatives propose de réaliser l’étape d’extraction des ARN totaux de vos échantillons.
Bioalternatives peut également effectuer de manière plus spécifique l’extraction de :
- miRNA
- ARNm
- ADN
Applications :
- RT-qPCR
- Analyse de transcriptome par microarray
- Analyse de l’expression de miRNA (RT-qPCR ou microarray)
Contrôle qualité des ARN
La qualité des ARN extraits est très dépendante des conditions dans lesquelles les échantillons ont été préparés, prélevés et conservés. Une fois l’étape l’extraction d’ARN effectuée, il convient donc de soumettre les échantillons à un contrôle qualitatif et quantitatif :
- La quantité des ARN extraits est déterminée par spectrophotométrie (spectrophotomètre Nanovue™, GE Healthcare).
- La qualité de l’ARN extrait est évaluée par électrophorèse en micro-capillaire à l’aide du Bioanalyzer 2100 de Agilent®. Le niveau de la qualité de l’ARN est associé à une valeur de RIN déterminée par l’appareil : plus cette valeur est proche de 10, plus la qualité de l’ARN est satisfaisante.
