L’étude du transcriptome global par microarrays (ou puces à ADN) permet d’obtenir un profil (qualitatif et quantitatif) de l’expression des gènes d’un échantillon (cellules, tissus, biopsies) à un moment donné ou dans une condition physiologique ou pathologique déterminée. Ce profil constitue dès lors une caractéristique intrinsèque à l’échantillon rendant possible de nombreuses applications : découverte de nouvelles cibles thérapeutiques, recherche de biomarqueurs, étude de mécanismes d’action ou de voies de signalisation, connaissances fondamentales…
Bioalternatives, service provider Affymetrix®, vous propose des prestations d’analyses transcriptomiques par microarrays (technologie des puces à ADN) basées sur l’utilisation de la plate-forme GeneAtlas®.
Microarrays
Parmi les microarrays de la gamme Affymetrix, nous proposons :
- Human Genome U219 Array Strip
- Human Genome U133+ PM Array Strip
- Rate Genome-230 PM Array Strip
- Mouse Genome-430 PM Array Strip
- Human Gene ST Array Strip
- Rate Gene ST Array Strip
- Mouse Gene ST Array Strip
- Canine Gene ST Array Strip
- Feline Gene ST Array Strip
- miRNA Array Strip
En plus de rendre possible l’analyse d’expression de gènes à l’échelle du transcriptome entier, Bioalternatives vous propose l’analyse des micro-RNA grâce à la puce miRNA 4.1 dédiée à la détection de ces ARN non codants de petite taille.
Des système Gene Array Strip sont également disponibles pour la réalisation d’études à partir d’échantillons issus d’autres organismes. Consultez-nous !
Microarrays, analyses et services associés
Nos prestations d’analyses sur microarrays incluent :
- la préparation ou la récupération des échantillons biologiques
- l’extraction des ARN et leur contrôle qualité par électrophorèse capillaire (Agilent)
- l’hybridation sur microarrays
- le scanning
- la génération des données brutes au format CEL
- le contrôle qualité et la normalisation des données
avec en option des services complémentaires d’analyse bioinformatique et d’exploitation de données :
- une analyse standard des données (calcul de fold change et analyse statistique)
- une analyse fonctionnelle basique : comparaisons inter-groupes et étude des processus biologiques modulés (DAVID, IPA)
- une analyse fonctionnelle avancée comprenant un clustering et une identification des gènes-cibles et/ou des voies de signalisation modulées (IPA)
